高三自学不交学费不直接构成违法。从法律角度看，学生支付学费是基于与学校的教育服务合同，若选择自学并明确告知学校，理论上可协商减免学费。若出现学校强制要求缴费或因此影响学籍，问题就严重了，应及时咨询律师。
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从法律角度，处理此问题常见方式有：与学校协商、依据合同条款处理、寻求教育部门调解或法律途径解决。选择时，若合同条款清晰且学校态度积极，可优先考虑协商；若协商无果，可根据合同条款或教育法规寻求调解；必要时，通过法律途径维护自身权益。
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从法律角度，针对此问题在不同情况下的处理操作如下：1. 若合同中明确自学可减免学费，直接向学校提出申请并保留沟通记录。2. 若合同未提及，但学校有相关规定，可依据规定与学校协商，必要时录音或录像作为证据。3. 若学校拒绝协商且影响学籍，可收集证据（如学费收据、沟通记录）向教育部门投诉，并考虑委托律师发送律师函。4. 若上述途径均无效，可通过法律途径起诉学校，维护自身合法权益。在此过程中，务必保留所有相关证据以备不时之需。