员工与单位纠纷应按劳动争议处理。依据《劳动争议调解仲裁法》，应先协商调解，协商不成可仲裁，对仲裁不服再诉讼。不及时处理可能导致权益受损，如工资拖欠、福利被克扣等。
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员工与单位纠纷先协商。协商不成：1.向基层调解组织等申请调解；2.调解无果，向劳动仲裁委申请仲裁；3.对仲裁裁决不服，向法院提起诉讼。
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员工与单位纠纷常见处理方式有协商、调解、仲裁、诉讼。选择时应先尝试协商调解，无法解决则申请仲裁，仲裁不服再提起诉讼。